qPCR實驗操作與數(shù)據(jù)分析指南
一、實驗操作流程
樣品準備
RNA提取:使用Trizol法裂解樣本,加入異丙醇沉淀RNA,75%洗滌后溶解于無酶水中。
反轉(zhuǎn)錄:將RNA與逆轉(zhuǎn)錄酶混合,37℃孵育15分鐘,85℃滅活5秒。
qPCR體系配制
預(yù)混液配置:將SYBRGreen染料、引物和無酶水按比例混合,避免反復(fù)凍融。
加樣技巧:每樣本設(shè)3個重復(fù)孔,使用預(yù)混液減少誤差,槍頭需更換以防交叉污染。
上機運行
離心除氣泡:上機前短暫離心,輕彈管壁消除氣泡。
程序設(shè)置:采用三步法(變性、退火、延伸),熔解曲線驗證引物特異性。
二、數(shù)據(jù)分析方法
數(shù)據(jù)預(yù)處理
Ct值計算:記錄熒光信號達到閾值的循環(huán)數(shù),內(nèi)參基因(如GAPDH)用于標準化。
△Ct值:目的基因Ct值減去內(nèi)參基因Ct值,消除樣本間差異。
相對定量計算
法:實驗組△Ct值減去對照組△Ct值,計算相對表達量。
示例公式:若實驗組△Ct為4.43,對照組為3.21,則表達量為2^(4.43-3.21)=2^1.22≈2.28倍。
結(jié)果可視化
圖表繪制:使用GraphPadPrism繪制柱狀圖,橫坐標為樣本組別,縱坐標為相對表達量。
三、常見問題與優(yōu)化
引物設(shè)計:擴增子長度建議80-200bp,避免二聚體形成。
陰性對照:用水替代模板,若出現(xiàn)擴增信號需檢查引物特異性。
重復(fù)性差:預(yù)混液分裝后加樣,減少操作誤差。
提示:實驗前需驗證引物擴增效率,數(shù)據(jù)需包含至少3個重復(fù)孔以提高可靠性。
注:以上僅供參考,不作為實際數(shù)據(jù),實驗需嚴格遵循說明或咨詢技術(shù)老師。Elisa試劑盒
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